Cryo-EM/ET image processing forum

Jack_Zhang

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Jack_Zhang

Ming_BioEM 发表于 2017-7-10 23:35
楼主大神，我刚做电镜不久，能请教你一个问题吗，在你最新的cell paper里，在处理冷冻数据的时候为什么选择 ...

因为template用的是CTF矫正过的2D，不做phase flip 30埃以上的信息全部都是错的，对挑颗粒完全没有用。做了phase flip之后就可以把分辨率用的更高了，比方10-12埃。但不建议用的更高，否则bias太严重，很可能挑出假颗粒出来。后续的data processing 如果是用Relion程序，则不用在phase flipped micrograph上进行，还是用原来的；当然你也可以用phase flipped micrograph，这样就相当于做过相位矫正了，可以使用更小的box extract particle，后续Relion中CTF 选项“are the particles phase flipped”选yes就行。