Cryo-EM/ET image processing forum

Ming_BioEM

楼主大神，我刚做电镜不久，能请教你一个问题吗，在你最新的cell paper里，在处理冷冻数据的时候为什么选择在做过phase flipped的micrograph上pick particle呢？后续的data processing是不是都是在phase flipped的micrograph基础上完成的？

Ming_BioEM

Jack_Zhang 发表于 2017-7-11 01:47
因为template用的是CTF矫正过的2D，不做phase flip 30埃以上的信息全部都是错的，对挑颗粒完全没有用。做 ...

那如果我是从raw micrograph里manual pick了2K多个particle，然后在relion里做2D作为autopick的template，这个2D的结果也是CTF矫正过的，但是分辨率只有20埃，在用Gautomatch的时候，micrograph需要lowpass到temple一样的分辨率吗（--lp 20）？raw micrograph需要phase flip处理吗？还是将template做lowpass到30埃以下在raw micrograph里automatch？

Ming_BioEM

admincryoem 发表于 2017-7-11 17:15
你不需要对raw micrograph做low-pass，Gautomatch里面的 --lp选项 设一个合理的值它会自己做。如果只用到 ...

好的，谢谢大神这么详细的解释