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manual particle picking in relion1.3

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楼主
发表于 2017-8-5 10:27:06 | 显示全部楼层 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
各位好,本人刚开始转入电镜领域,现在在用relion1.3和relion-2.0练习。在用relion-1.3做完manual picking后再做particl extract 时出现错误。意思是XXX_manual.star文件不存在。可是在文件夹Micrograph里是存在的,不知道是什么原因。请各位帮忙解答下,不胜感激。
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沙发
 楼主| 发表于 2017-8-5 16:32:34 | 显示全部楼层
我是这样做的:在inspection里 input放入_ctf.star.然后 outputSTAR file是_manual.star 。picking rootname:manualpick 然后点run就出现了所以有的数据。选 取了 particle。然后右击save coordination。按照protocol选取了在前几张里大概>1000个particles。 再做extraction.设置是micrograph STAR还是ctf_star  然后coordinat-file suffix是_manual.star,然后extact rootname 是manual。请问我的操作是正确的吗?
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 楼主| 发表于 2017-8-7 10:44:00 | 显示全部楼层

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地板
 楼主| 发表于 2017-8-8 16:18:32 | 显示全部楼层
好的,十分感谢。能否分享下你们在做重构的时候一般习惯的步骤是什么啊,我们这边没有人在做这块的。
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