Cryo-EM 初学者入门书籍和视频（慢慢整理中）

Jack_Zhang

Structural analysis of macromolecular assemblies by electron microscopy.这篇文章总结的非常详细到位，是非常好的入门材料。
不过我个人不太同意其中关于三维重构的分类。文章将三维重构分为“实空间”和“傅里叶空间”，其实从纯粹数学的抽象观点而言，在没有量纲以及没有应用前提的条件下，你根本不知道目标信号是“实空间“还是“傅里叶”空间，这只是两个对偶的空间而已，我们定义蛋白质密度图为“实空间”，这只是人为习惯而已。实际上，背投影系列（直接背投影、加权背投影、滤波背投影、卷积背投影）和傅里叶系列重构是等价的，都属于“分析型”算法，只不过是在两个对偶的空间进行处理而已。而解线性方程组的代数迭代类（ART，SIRT，SART等）则有本质不同，不能以为是在“实空间”处理，而划分为“实空间”算法。正确的划分为“分析类”和“迭代类”两大类，每一类又衍射出若干子类等等。

Jack_Zhang

Zheng_Liu 发表于 2017-6-27 23:56
这篇文章的作者在London， 有过当面交流吗？我看过他们写了不少方法介绍，综述性的文章。
他们综述的角度 ...

其实这样划分对生物学家而言是没有任何问题的，这样划分看起来也挺“具体”，而且也没有必要了解那么多，具体应用的时候不过就是几个button选择一下而已。只是我觉得如果作为理解深入的原理，还有必要从更高的抽象层次来分类，这样overall的思路更加清晰。我多年前参加过他们的workshop，没有细聊过这些。

Jack_Zhang

辛苦各位了，太棒了！

Jack_Zhang

后面可以再继续分享一些Ecryo-EM领域经典的paper。