在之前微信群的讨论中,张凯老师和雨辰老师都对于nyquist频率的本质问题给出了深入浅出的解答。我理解的是,现在普遍认为2/3的nyquist频率是置信的区间,翻过来就是三倍的pixelsize。
最近阅读了Grigorieff实验室对于E. coli核糖体动态结构的文献(Ensemble cryo-EM elucidates the mechanism of translation fidelity),里面提到在数据收集中,“for both datasets, the super-resolution pixel size was 0.82A on the sample",是否就是实际pixelsize为1.64?而它报道的实际分辨率最高达到了3.1A,所以基本达到了两倍的Pixelsize,可否认为当数据质量足够高时,软件可以做到区分1/2的Nyquist频率信号?
同样的问题,在收集类似ribosome这类信号足够强的数据时,counting模式和super-resolution 模式有没有太大的区别?